W Centrum będą się także znajdowały profilowane oddziały psychiatryczne, takie jak oddział nerwic młodzieżowych i oddział niedoborów odżywiania, zajmujący się takimi schorzeniami jak anoreksja i bulimia.

W Centrum znajdzie się także hostel, w którym młodzież z zaburzeniami psychicznymi niewymagająca leczenia szpitalnego będzie mogła przebywać nawet do 10 miesięcy. Dla tych osób będą prowadzone profilowane programy psychoterapeutyczne rehabilitacyjne w celu poprawy codziennego funkcjonowania oraz przywrócenia podstawowych umiejętności społecznych. Ponadto w Centrum będzie się mieściło centrum zdrowia psychicznego dla dzieci i młodzieży – II poziom referencyjny oraz ośrodek środowiskowej opieki psychologicznej i psychoterapeutycznej dla dzieci i młodzieży – I poziom referencyjny.

Centrum Psychiatrii Dzieci i Młodzieży, będzie ściśle współpracowało z Oddziałem psychiatrycznym dla dzieci i młodzieży zlokalizowanym w Wojewódzkim Zespole Lecznictwa Psychiatrycznego w Olsztynie na al. Wojska Polskiego.

Na Warmii i Mazurach tego typu centrum jest koniecznością.

Obecnie trwają prace koncepcyjne nad przygotowaniem kompleksowego projektu Centrum, a także przygotowanie istniejącej infrastruktury Szpitala umożliwiające jak najszybsze uruchomienie stacjonarnych świadczeń psychiatrycznych dla dzieci (jeden oddział ogólnopsychiatryczny dla dzieci i młodzieży), co z jednej strony umożliwi poprawę sytuacji dzieci z problemami psychicznymi, a z drugiej strony pozwoli na rozpoczęcie zatrudniania i szkolenia kadry na potrzeby przyszłego Centrum.